当员工遇到老板故意扣工资的情况时，可以通过以下途径进行投诉：
一、劳动监察部门投诉
劳动者可以通过拨打12333全国劳动保障咨询投诉举报热线，或向所在地劳动监察部门进行投诉举报。提供扣工资相关证据材料，如工资条、劳动合同等。劳动监察部门接到投诉后会进行调查处理，如发现用人单位确实存在扣发工资行为，会责令其支付欠款并处以罚款。
二、仲裁委员会投诉
劳动者还可以向所在地劳动人事争议仲裁委员会提起仲裁申请。需要提交仲裁申请书、被申请人联系方式、相关证据材料。仲裁委员会经过审理后，会作出裁决，裁决对双方均具有约束力。如果用人单位不服仲裁结果，可以在收到裁决书后15日内向人民法院提起诉讼。
三、法院起诉
劳动者还可以直接向人民法院提起诉讼，要求用人单位支付拖欠工资。诉讼时需提供劳动合同、工资条等证据，证明用人单位存在扣发工资的行为。法院受理后会进行审理，并作出判决。
四、举报查处
如果用人单位存在故意扣发工资并虚报工资总额等违法行为，劳动者也可以向税务部门进行举报。税务部门查实后会对用人单位进行处罚，并责令其补缴税款。
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